村庄危房改造补助资金分配运用遵从以下准则：
（一）科学合理，公平客观。公平、合理地分配补助资金，防止出现盲目性和随意性。
（二）顾全大局。在优先支撑贫穷农户、并向财务困难区域歪斜的一起，全体推动全国村庄危房改造。
（三）绩效评估，规范处理。树立绩效评估准则，改进项目施行和资金处理机制。
（四）当地各级财务、展开变革、住宅城乡建造部分要实在施行村庄危房改造当地补助资金，加速推动村庄危房改造作业。不断改进村庄危房改造投入机制，活跃引导信贷资金、民间资金等社会各方面资金投入。
省级住宅城乡建造、展开变革和财务部分依据各地实践需求，按规则时刻提出下一年度危房改造使命和补助资金请求及施行方案，并以正式文件联合上报住宅城乡建造部、国家改革委员会和财务部。住宅城乡建造部、国家改革委员会、财务部依据当年全国村庄危房改造规划、中心补助资金预算组织状况以及省级有关部分申报危房改造使命和补助资金状况，统筹考虑各地村庄危房户数、农户数、改形资金、改造作用、财力状况等要素，断定各地危房改造使命。
财务部会同国家改革委员会、住宅城乡建造部依据改造使命和补助规范，分配下达中心村庄危房改造补助资金。省级财务部分会同展开变革、住宅城乡建造部分，在接到中心补助资金文件后30天内，依据辖区危房改造使命分配状况，将中心补助资金和本级政府组织的村庄危房改造资金，拨付到下级财务部分。市、县级财务部分也要活跃组织村庄危房改造补助资金，并及时将上级和本级政府组织的补助资金于30日内及时拨付到位。财务部分、展开变革、住宅城乡建造等部分详细担任本区域村庄危房改造补助资金的付出、处理以及日常监督查看作业，严厉依照规则组织和付出村庄危房改造补助资金。